RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 ABHD16AO95870 558 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 IL2RAP01589 272 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TIMP3P35625 211 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 AQP6Q13520 282 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 LIPNQ5VXI9 398 aa18.23■□□□□ 0.51
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PACSIN3-201ENST00000298838 GPR50Q13585 617 aa18.22■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa18.22■□□□□ 0.51
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PACSIN3-201ENST00000298838 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa18.22■□□□□ 0.51
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PACSIN3-201ENST00000298838 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 RPRMLQ8N4K4 120 aa18.21■□□□□ 0.51
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PACSIN3-201ENST00000298838 LRP12Q9Y561 859 aa18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 RER1O15258 196 aa18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF254O75437 659 aa18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFSF13O75888 250 aa18.21■□□□□ 0.51
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PACSIN3-201ENST00000298838 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 GADD45AP24522 165 aa18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TGM4P49221 684 aa18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ARF1P84077 181 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 C9orf135Q5VTT2 229 aa18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 OR7E24Q6IFN5 339 aa18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
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PACSIN3-201ENST00000298838 CENPMQ9NSP4 180 aa18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 NBEAQ8NFP9 2946 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF878C9JN71 531 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 H3BMQ9 156 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 AIREO43918 545 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 H2BFMP0C1H6 154 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 NR4A1P22736 598 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 MPGP29372 298 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 GABRA5P31644 462 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMB10P40306 273 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 OPRL1P41146 370 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CDK5R1Q15078 307 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM19Q96E16 107 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 TINAGQ9UJW2 476 aa18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 PLPP2O43688 288 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 CTF1Q16619 201 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC16A14Q7RTX9 510 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 OR10S1Q8NGN2 331 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO17Q96EF6 278 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNN2Q9H2S1 579 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 STUB1Q9UNE7 303 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 OGG1O15527 345 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 GLI4P10075 376 aa18.19■□□□□ 0.5
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PACSIN3-201ENST00000298838 Q6ZT83 130 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 NAXEQ8NCW5 288 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM203Q969S6 136 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 WACQ9BTA9 647 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 OR51E2Q9H255 320 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 PROCRQ9UNN8 238 aa18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 USP24Q9UPU5 2620 aa18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3-201ENST00000298838 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa18.18■□□□□ 0.5
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