RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 GASTP01350 101 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 CSF3P09919 207 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 KIR2DS2P43631 304 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 PPP1CAP62136 330 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 FAM122BQ7Z309 247 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 PIGMQ9H3S5 423 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.56□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 ASB13Q8WXK3 278 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 CSF3RQ99062 836 aa8.56□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.56□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 BCL6P41182 706 aa8.55□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 USP22Q9UPT9 525 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 MED12LQ86YW9 2145 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 G3V3Q6 166 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 S100A8P05109 93 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 TPOP07202 933 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 M6PRP20645 277 aa8.55□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.55□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 OR2M7Q8NG81 312 aa8.55□□□□□ -1.04
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CUX1-201ENST00000292535 OR2M5A3KFT3 312 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 NXPH3O95157 252 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 Q1RN00 199 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 CLEC14AQ86T13 490 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SEH1LQ96EE3 360 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 EFSO43281 561 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 ALOX12BO75342 701 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 CHRM2P08172 466 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 BTN1A1Q13410 526 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-201ENST00000292535 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.55□□□□□ -1.04
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