RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 SC5DO75845 299 aa18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 F12P00748 615 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 EMC4Q5J8M3 183 aa18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF676Q8N7Q3 588 aa18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNG2Q9UJ96 466 aa18.85■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 GPR179Q6PRD1 2367 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAD1O60671 282 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPDEFO95238 335 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 GIFP27352 417 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 SGCBQ16585 318 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 NTRK2Q16620 822 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR5L2Q8NGL0 311 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 EDARADDQ8WWZ3 215 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 DEFB126Q9BYW3 111 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 FREM3P0C091 2139 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGF2P01344 180 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 THBS2P35442 1172 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 PITPNBP48739 271 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 CLDN12P56749 244 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPL27P61353 136 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 IZUMO1Q8IYV9 350 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR5AK2Q8NH90 309 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 MR1Q95460 341 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 RHOVQ96L33 236 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 DERL3Q96Q80 235 aa18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 MT-ATP6P00846 226 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 HLA-DOBP13765 273 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 SRMP19623 302 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 ULBP3Q9BZM4 244 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 CYSLTR2Q9NS75 346 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 A0A0G2JK05 382 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 EPXP11678 715 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRRN1Q6UXK5 716 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR2T1O43869 369 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZFAND5O76080 213 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 TXNDC12O95881 172 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 MEP1BQ16820 701 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAB11FIP2Q7L804 512 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 OVCH2Q7RTZ1 564 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR5BQ86VZ2 330 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR10G3Q8NGC4 313 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR5M1Q8NGP8 315 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 PDCD10Q9BUL8 212 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 TAS2R3Q9NYW6 316 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 NUP210LQ5VU65 1888 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 PMS2P1A4D2B8 440 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARPC5O15511 151 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 GPRIN2O60269 458 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC25A25Q6KCM7 469 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 TCF7L1Q9HCS4 588 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRSS37A4D1T9 235 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 GPR171O14626 319 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 UCHL1P09936 223 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCL4P13236 92 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF28P17035 718 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 SSTP61278 116 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 EXD3Q8N9H8 876 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 RFT1Q96AA3 541 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 SOSTQ9BQB4 213 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 SEMA4CQ9C0C4 833 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 DLL4Q9NR61 685 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 DISC1C4P0D8 188 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADAM8P78325 824 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 FOXF1Q12946 379 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 NUP54Q7Z3B4 507 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 AMELYQ99218 206 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 B9D1Q9UPM9 204 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 NPR2P20594 1047 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF26BQ2KJY2 2108 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 NHLRC3Q5JS37 347 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM198BQ6UWH4 519 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 MISPQ8IVT2 679 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 NUBPLQ8TB37 319 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 LGALS14Q8TCE9 139 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABHD1Q96SE0 405 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNTTIP1Q9H147 329 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYOTQ9UBF9 498 aa18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms