RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 DVL2O14641 736 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 HSD11B1P28845 292 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 S100A10P60903 97 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ZNF616Q08AN1 781 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 LINC00114Q6XXX2 140 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 STK35Q8TDR2 534 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 MICU1Q9BPX6 476 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 PIGQQ9BRB3 760 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 UPB1Q9UBR1 384 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 COL4A3Q01955 1670 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 A0A1W2PQD3 144 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 SHISA3A0PJX4 238 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 C2orf72A6NCS6 295 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 HSPB2A8KAH6 182 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 J3QRE1 110 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 TMEM127O75204 238 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ZFPL1O95159 310 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 SORDQ00796 357 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 LTBQ06643 244 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 HSPB2Q16082 182 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 NAXEQ8NCW5 288 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 OR56B4Q8NH76 319 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ORAI1Q96D31 301 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 DERL3Q96Q80 235 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 MIOXQ9UGB7 285 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 KNTC1P50748 2209 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 DDAH2O95865 285 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 CALCBP10092 127 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 TMEM156Q8N614 296 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 C14orf79Q96F83 325 aa14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 UEVLDQ8IX04 471 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ST8SIA1Q92185 356 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 FBXO17Q96EF6 278 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 GPR27Q9NS67 375 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 B9D1Q9UPM9 204 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 H7C1Q1 480 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 LAMTOR5O43504 91 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 MBP02144 154 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ZNF20P17024 532 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 S100PP25815 95 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 VEGFCP49767 419 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 NAA40Q86UY6 237 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 EID2Q8N6I1 236 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 HHLA2Q9UM44 414 aa14.71□□□□□ -0.05
CTCF-201ENST00000264010 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.71□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PRAF2O60831 178 aa14.71□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 MMP15P51511 669 aa14.71□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.71□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.71□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.71□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CMTM3Q96MX0 182 aa14.71□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ABHD1Q96SE0 405 aa14.71□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.71□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 A0A0A6YYJ9 748 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 GTF2F2P13984 249 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 IL9P15248 144 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 KDM8Q8N371 416 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CYTIPO60759 359 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 IGF2P01344 180 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CD1AP06126 327 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.7 ms