RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 MDGA2Q7Z553 956 aa5.76□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.76□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 GP2P55259 537 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 ZNF546Q86UE3 836 aa5.75□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 Q6ZNX1 250 aa5.75□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 SMIM4Q8WVI0 70 aa5.75□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.75□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 DHODHQ02127 395 aa5.75□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 DTX3Q8N9I9 347 aa5.75□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 NOXO1Q8NFA2 376 aa5.75□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.75□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 SEMG1P04279 462 aa5.75□□□□□ -1.49
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SETX-201ENST00000224140 CDONQ4KMG0 1287 aa5.75□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.75□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 TFAP2EQ6VUC0 442 aa5.75□□□□□ -1.49
SETX-201ENST00000224140 DCXRQ7Z4W1 244 aa5.75□□□□□ -1.49
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