RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 DLL4Q9NR61 685 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 RNF24Q9Y225 148 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 XKRY2A2RUG3 117 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 GPR37O15354 613 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ST8SIA5O15466 376 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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TRPS1-201ENST00000220888 PNLIPRP2P54317 469 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 OR10A3P58181 314 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PFN3P60673 137 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PLXDC2Q6UX71 529 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM108Q6UXF1 575 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 LACC1Q8IV20 430 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MMP28Q9H239 520 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 NTNG1Q9Y2I2 539 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 A0A0D9SG52 128 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PLPP1O14494 284 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 FGF17O60258 216 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 GABRG2P18507 467 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 HTR2BP41595 481 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF83P51522 516 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 UCNP55089 124 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MS4A2Q01362 244 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 IL11RAQ14626 422 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SHBQ15464 509 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM81Q6P7N7 255 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CA13Q8N1Q1 262 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 OR52H1Q8NGJ2 320 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TAS2R5Q9NYW4 299 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ETV7Q9Y603 341 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC37A3O60309 1634 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 H0Y8G0 127 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 UBL3O95164 117 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 HLA-HP01893 362 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 GABRB3P28472 473 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 HTR1FP30939 366 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 NOVP48745 357 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 UBA52P62987 128 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SORDQ00796 357 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ILKQ13418 452 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 FAM53BQ14153 422 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 OR51A4Q8NGJ6 313 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-201ENST00000220888 ADAM19Q9H013 955 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MYH2Q9UKX2 1941 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF785A8K8V0 405 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SELENOFO60613 162 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CXCL10P02778 98 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MEOX1P50221 254 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MDGA2Q7Z553 956 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 RAB1CQ92928 201 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 BANF2Q9H503 90 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-201ENST00000220888 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SBK2P0C263 348 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRPS1-201ENST00000220888 FCRL6Q6DN72 434 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 REEP6Q96HR9 211 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 AIPO00170 330 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MBTPS2O43462 519 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 NCR1O76036 304 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PAPLNO95428 1278 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CTRB1P17538 263 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ACKR1Q16570 336 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 GUSBP11Q6P575 273 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 RPEQ96AT9 228 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.62□□□□□ -0.87
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