RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 CORO6Q6QEF8 472 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 LUZP2Q86TE4 346 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 WDSUB1Q8N9V3 476 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 RNF170Q96K19 258 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 OXGR1Q96P68 337 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 OR51J1Q9H342 316 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 EMC3Q9P0I2 261 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 A0A1W2PQ72 361 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 GGT3PA6NGU5 568 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 AQP7P3A6NL99 342 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF878C9JN71 531 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 PRAF2O60831 178 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 PEX14O75381 377 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 CTAG2O75638 210 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ITGA5P08648 1049 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 GSTT2P0CG29 244 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 PGA4P0DJD7 388 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 PGA3P0DJD8 388 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ANXA3P12429 323 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 HTR2CP28335 458 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 HSD11B1P28845 292 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 GZMKP49863 264 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 CAPZA1P52907 286 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 IFITM2Q01629 132 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 FAPQ12884 760 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 TOMM20Q15388 145 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 DCAF12Q5T6F0 453 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 CD276Q5ZPR3 534 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 OR6X1Q8NH79 312 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 KLK11Q9UBX7 282 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF222Q9UK12 451 aa7.37□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 SSNA1O43805 119 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 RBBP9O75884 186 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 PMS2P2O95744 297 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ACP1P24666 158 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 DCTDP32321 178 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 MMP16P51512 607 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ANGPT1Q15389 498 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 FCN2Q15485 313 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 TAF13Q15543 124 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 BCL2A1Q16548 175 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 CARD17Q5XLA6 110 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 HYLS1Q96M11 299 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 STRADBQ9C0K7 418 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 GHITMQ9H3K2 345 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 ING4Q9UNL4 249 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 A0A1B0GVI7 797 aa7.36□□□□□ -1.23
VAMP3-201ENST00000054666 P2RY10O00398 339 aa7.36□□□□□ -1.23
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