RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr560A0A1B0GSU5 314 aa26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp362B1ASA5 418 aa26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Psmb10O35955 273 aa26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hmox2O70252 315 aa26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nudt2P56380 147 aa26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q149G0 166 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gpat2Q14DK4 801 aa26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trim67Q505D9 768 aa26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mfn2Q80U63 757 aa26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gpr107Q8BUV8 551 aa26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Grk5Q8VEB1 590 aa26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr970Q8VFN3 311 aa26.89■■□□□ 1.9
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1123A2AT85 323 aa26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slco5a1E9PVD9 850 aa26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 H2-ObO35424 271 aa26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ItgamP05555 1153 aa26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pcmt1P23506 227 aa26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Map2k6P70236 334 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tusc1Q673H1 205 aa26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tas2r110Q7M712 333 aa26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1229Q7TQZ9 311 aa26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hapln4Q80WM4 400 aa26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Smndc1Q8BGT7 238 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Duoxa1Q8VE49 341 aa26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cd276Q8VE98 316 aa26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1232Q8VEX7 311 aa26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 SlirpQ9D8T7 112 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ilf3Q9Z1X4 898 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 9330182O14RikJ3QNB2 140 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm6803J3QPI8 144 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm8888J3QPX5 126 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GcdhQ60759 438 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tspan14Q8QZY6 270 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr215Q8VF82 310 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr658Q8VGV5 323 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ier3ip1Q9CR20 82 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ints12Q9D168 461 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MeiobQ9D513 470 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PolmQ9JIW4 496 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Igkv9-124A0A0G2JDR3 117 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hsd17b10O08756 261 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 P01655 112 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kcne1P23299 129 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fosl1P48755 273 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lsg1Q3UM18 644 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nkain2Q4PNJ2 208 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Snap91Q61548 901 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cfap161Q6P8Y0 303 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Serpina3fQ80X76 445 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Scn3bQ8BHK2 215 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Csnk1a1Q8BK63 337 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc32Q8BS39 179 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Crtac1Q8R555 646 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1048Q8VGS2 320 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr572Q8VGZ3 318 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdca3Q99M54 266 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Snapc3Q9D2C9 407 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MtfmtQ9D799 386 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem54Q9D7S1 219 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fscn3Q9QXW4 498 aa26.87■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nsun4C4P6S0 806 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 S1pr1O08530 382 aa26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MstnO08689 376 aa26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zmat3O54836 290 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gadd45aP48316 165 aa26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Drd4P51436 387 aa26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klhl21Q3U410 597 aa26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ahcyl1Q80SW1 530 aa26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Jazf1Q80ZQ5 243 aa26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cnot4Q8BT14 575 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 4933428M09RikQ9D3X3 192 aa26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tex44Q9DA60 530 aa26.86■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Igkv13-85A0A075B666 115 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 D7Ertd443eD2J0Y4 644 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tex264E9Q137 309 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Raet1aO08602 253 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Raet1bO08603 253 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ca2P00920 260 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fxyd2Q04646 70 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 HgfQ08048 728 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bhlha9Q5RJB0 231 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Surf4Q64310 269 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Azgp1Q64726 307 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1140Q7TR39 311 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ndrg4Q8BTG7 352 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cnppd1Q8K158 407 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ugt2b37Q8VCN3 530 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rhox9Q9EQM5 227 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc9a3r2Q9JHL1 337 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sh3bgrlQ9JJU8 114 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc7a5Q9Z127 512 aa26.85■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm13102A2ASJ3 519 aa26.84■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r137D3YTY1 307 aa26.84■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r143E9PUW9 307 aa26.84■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r157E9Q069 297 aa26.84■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r139E9Q8L6 297 aa26.84■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm9772F6XPD8 135 aa26.84■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r112G3UY48 297 aa26.84■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r135K9J7G0 307 aa26.84■■□□□ 1.89
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r125L7N227 307 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.4 ms