RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639809.1

SPIN3-229, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,118 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-229	ENST00000639809	NFYC	Q13952	458 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	VMAC	Q2NL98	169 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	SYT9	Q86SS6	491 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	SPIC	Q8N5J4	248 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	TMEM239	Q8WW34	195 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	RBP7	Q96R05	134 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	SH3GL1	Q99961	368 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	ESM1	Q9NQ30	184 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	NPTN	Q9Y639	398 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	SLC2A10	O95528	541 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	IFNA14	P01570	189 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	CST2	P09228	141 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	TNFSF4	P23510	183 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	CDA	P32320	146 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	MPV17	P39210	176 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	PPP1CB	P62140	327 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	LCN2	P80188	198 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	CD47	Q08722	323 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	SGCA	Q16586	387 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	DOK3	Q7L591	496 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	OR10A6	Q8NH74	314 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	MED31	Q9Y3C7	131 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	IGHV2-70	P01814	119 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	IGHM	P01871	453 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	COX5B	P10606	129 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	TNFRSF1A	P19438	455 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	GSTM3	P21266	225 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	PRTN3	P24158	256 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	SELPLG	Q14242	412 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	PFN4	Q8NHR9	129 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	ABHD4	Q8TB40	342 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	C4orf45	Q96LM5	186 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	SAMD8	Q96LT4	415 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	MRGBP	Q9NV56	204 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809		A6NIZ1	184 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	IFNL4	K9M1U5	179 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	TMPRSS2	O15393	492 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	DCTN3	O75935	186 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	IFNA8	P32881	189 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	GZMM	P51124	257 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	CRYBA2	P53672	197 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	RAP1B	P61224	184 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	RAP1A	P62834	184 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	ERVK-25	P63136	954 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	CDK5R2	Q13319	367 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	ALG10	Q5BKT4	473 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	NSMAF	Q92636	917 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	LRRC58	Q96CX6	371 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	COG8	Q96MW5	612 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	MRI1	Q9BV20	369 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	SAR1A	Q9NR31	198 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-229	ENST00000639809	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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