RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	TLE3	Q04726	772 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM205	Q6UW68	189 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR52N5	Q8NH56	324 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM234	Q8WY98	164 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GTQ1	180 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152		H7C417	338 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFB6	O95139	128 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CD2	P06729	351 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TPO	P07202	933 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CRABP1	P29762	137 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF627	Q7L945	461 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CKLF	Q9UBR5	152 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CACNA1E	Q15878	2313 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PQ72	361 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SLC17A2	O00624	439 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A5	O76082	557 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	MPC2	O95563	127 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CD3D	P04234	171 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ROM1	Q03395	351 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	FOXF1	Q12946	379 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	POU4F3	Q15319	338 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TSSK4	Q6SA08	328 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	STK35	Q8TDR2	534 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM127	O75204	238 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SIX6	O95475	246 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SNTA1	Q13424	505 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	FDX2	Q6P4F2	183 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CARF	Q8N187	725 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CMKLR1	Q99788	373 aa		11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	HSPB2	A8KAH6	182 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	HRG	P04196	525 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS3	P35030	304 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	DNASE1L1	P49184	302 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	FOXK1	P85037	733 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	HSPB2	Q16082	182 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	NKD1	Q969G9	470 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	RTTN	Q86VV8	2226 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CIB4	A0PJX0	185 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ALOX12B	O75342	701 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SCRG1	O75711	98 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	HTR2C	P28335	458 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	MNDA	P41218	407 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	HSF1	Q00613	529 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SHB	Q15464	509 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	GRK1	Q15835	563 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ESX1	Q8N693	406 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	ASB10	Q8WXI3	467 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BRF1-222	ENST00000635152	NPTN	Q9Y639	398 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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