RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	AQP5	P55064	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1CB	P62140	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PHEX	P78562	749 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PSG7	Q13046	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXE3	Q13461	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB135	Q30KP9	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	STPG2	Q8N412	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MNT	Q99583	582 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	EPYC	Q99645	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXB1	Q99853	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2F2	O95006	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	VAMP5	O95183	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CD74	P04233	296 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	AHCY	P23526	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	NMBR	P28336	390 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MAPK12	P53778	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GNB1	P62873	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR50	Q13585	617 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT31	Q15323	416 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZWC4	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	STMN2	Q93045	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	DDIT4L	Q96D03	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		I3L521	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP7B1	O75881	506 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GPI	P06744	558 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	KLK1	P06870	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPAN8	P19075	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GSTM3	P21266	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MAPK1	P28482	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	WNT5A	P41221	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CDKN2B	P42772	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR12	P47775	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ENTPD1	P49961	510 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR12D2	P58182	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	IL2	P60568	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR7A5	Q15622	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MAPK14	Q16539	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PDK4	Q16654	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8TCH9	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5B12	Q96R08	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms