RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612980.4

RDM1-215, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDM1, Length 501 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-215	ENST00000612980	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ABCG5	Q9H222	651 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	STMN3	Q9NZ72	180 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ABCA1	O95477	2261 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980		A0A0G2JMP0	313 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980		A0A0X1KG70	313 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980		A0A1W2PRG6	482 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980		A8MUA0	341 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF879	B4DU55	563 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	MEN1	O00255	615 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	SCD	O00767	359 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	PDCD5	O14737	125 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	SELENOF	O60613	162 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	SCRG1	O75711	98 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	OR2B3	O76000	313 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF432	O94892	652 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ABHD16A	O95870	558 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	PAH	P00439	452 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	YES1	P07947	543 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ATF1	P18846	271 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	EDNRA	P25101	427 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	TACR3	P29371	465 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	BTC	P35070	178 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	OR1D4	P47884	311 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	CENPA	P49450	140 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	GZMK	P49863	264 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	CCR9	P51686	369 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	SLC16A1	P53985	500 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	SOX8	P57073	446 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	RAB25	P57735	213 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	EGR3	Q06889	387 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ZP4	Q12836	540 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	TNK1	Q13470	666 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	CDK10	Q15131	360 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	POU4F3	Q15319	338 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	HSPB2	Q16082	182 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF511	Q8NB15	262 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		4.24	□□□□□ -1.73
RDM1-215	ENST00000612980	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73

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