RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 GMNCA6NCL1 334 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 HMGN4O00479 90 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FCMRO60667 390 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 B3GALNT1O75752 331 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 TRAPPC6AO75865 159 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SNX4O95219 450 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ANGPTL1O95841 491 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 IGHG3P01860 377 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 KRT16P08779 473 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MYOD1P15172 320 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 DLX5P56178 289 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 SLC10A1Q14973 349 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CD226Q15762 336 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SYPL1Q16563 259 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SGCBQ16585 318 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MTX3Q5HYI7 312 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 COMMD2Q86X83 199 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CDC20BQ86Y33 519 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF614Q8N883 585 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ZFP90Q8TF47 636 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SMR3AQ99954 134 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 DSN1Q9H410 356 aa6.69□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.69□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MED11Q9P086 117 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 A0A096LPI6 279 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.68□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 C15orf62A8K5M9 175 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.68□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 BCKDKO14874 412 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CTDSPLO15194 276 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PRAF2O60831 178 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 HPNP05981 417 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ATP6V1C1P21283 382 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 TBXA2RP21731 343 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SLC6A6P31641 620 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CRATP43155 626 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MMP15P51511 669 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ISL1P61371 349 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.68□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 C10orf111Q8N326 155 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ANKFN1Q8N957 763 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FADS6Q8N9I5 356 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 OR2M3Q8NG83 312 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SDF2Q99470 211 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.68□□□□□ -1.34
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