RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 V9GY05 133 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PQ72 361 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4C45A6NMZ5 311 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 IFITM5A6NNB3 132 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 CENPXA8MT69 81 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 AGFG2O95081 481 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 AKR7A3O95154 331 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 HPP00738 406 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8G3PP0DMU2 310 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A1P30531 599 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 DAP3P51398 398 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 C1QL3Q5VWW1 255 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC18B1Q6NT16 456 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 LYPD4Q6UWN0 246 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 PM20D2Q8IYS1 436 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2G2Q8NGZ5 317 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF417Q8TAU3 575 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 DDIT4LQ96D03 193 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 MRGPRX4Q96LA9 322 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 BRD7Q9NPI1 651 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 EXPH5Q8NEV8 1989 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 MPDZO75970 2070 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB25P57735 213 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 CARTPTQ16568 116 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ATAD3CQ5T2N8 411 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB40AQ8WXH6 277 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 C8orf44Q96CB5 159 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A36Q96CQ1 311 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 NEK6Q9HC98 313 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A23A1A5C7 686 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM200CA6NKL6 621 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM171A2A8MVW0 826 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 TFECO14948 347 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 PAHP00439 452 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO45P0C2W1 286 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF224P0DH78 156 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX30Q5JUR7 227 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF671Q8TAW3 534 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR148Q8TDV2 347 aa22.71■■□□□ 1.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 ABCG5Q9H222 651 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHA1Q9HB21 404 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-204ENST00000587718 FRRS1LQ9P0K9 344 aa22.71■■□□□ 1.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 DYRK1AQ13627 763 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM81Q6P7N7 255 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 LYPD8Q6UX82 237 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 IL20RBQ6UXL0 311 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 DPY19L4Q7Z388 723 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF679Q8IYX0 411 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5H6Q8NGV6 325 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 SSC4DQ8WTU2 575 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 NSMAFQ92636 917 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 C4orf45Q96LM5 186 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 TCF7L1Q9HCS4 588 aa22.7■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 CACNG2Q9Y698 323 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf98E9PRG8 122 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 COX6A1P12074 109 aa22.69■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 PUDPQ08623 228 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR176Q14439 515 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC17A1Q14916 467 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 PLA1AQ53H76 456 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF128Q8TEB7 428 aa22.69■■□□□ 1.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 MYOTQ9UBF9 498 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 GLO1Q04760 184 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 NTRK2Q16620 822 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 TBRG1Q3YBR2 411 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 POMZP3Q6PJE2 187 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFAF7Q7L592 441 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-204ENST00000587718 TCTE3Q8IZS6 198 aa22.68■■□□□ 1.22
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