RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 HYAL4Q2M3T9 481 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 CEP78Q5JTW2 689 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRFN4Q6PJG9 635 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 DCXRQ7Z4W1 244 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNX29P2Q8IUI4 249 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 LYSMD2Q8IV50 215 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 MINDY2Q8NBR6 621 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2V1Q8NHB1 315 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF133Q8WVZ7 376 aa25.25■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC39A7Q92504 469 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2M2Q96R28 347 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAXQ9Y2V3 346 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARGFXA6NJG6 315 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 NPIPA2E9PIF3 369 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 NPIPA3F8WFD2 350 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ENPP1P22413 925 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIR3DL2P43630 455 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 MFAP5Q13361 173 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 OXA1LQ15070 435 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC25A25Q6KCM7 469 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF544Q6NX49 715 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 CENPSQ8N2Z9 138 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZIC4Q8N9L1 334 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR10H5Q8NGA6 315 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 THRSPQ92748 146 aa25.24■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SOSTQ9BQB4 213 aa25.24■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GLTPQ9NZD2 209 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 COMMD3Q9UBI1 195 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRP12Q9Y561 859 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 H0YC42 278 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TBX1O43435 398 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SRMP19623 302 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF79Q15937 498 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 WDR38Q5JTN6 314 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 C10orf128Q5T292 105 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM123Q8N131 208 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GPR171O14626 319 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 WNT11O96014 354 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 OR10A3P58181 314 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SPACA3Q8IXA5 215 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 HAS2Q92819 552 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 TTTY12Q9BZ98 90 aa25.23■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC19A2O60779 497 aa25.22■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DCTDP32321 178 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 IDNKQ5T6J7 187 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 CARD17Q5XLA6 110 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 STEAP3Q658P3 488 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 XKRXQ6PP77 449 aa25.22■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF676Q8N7Q3 588 aa25.22■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SRRQ9GZT4 340 aa25.22■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 EVX1P49640 407 aa25.21■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 R4GMQ9 66 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1W2PPL8 197 aa25.2■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 FABP12A6NFH5 140 aa25.2■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa25.2■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 WT1P19544 449 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 CSNK1A1P48729 337 aa25.2■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 STARP49675 285 aa25.2■■□□□ 1.63
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