RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, human

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMOD3-208	ENST00000560725	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OSTF1	Q92882	214 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CUTC	Q9NTM9	273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RNF24	Q9Y225	148 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	MAST4	O15021	2626 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TXNDC9	O14530	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	HCRTR1	O43613	425 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	HP	P00738	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	STS	P08842	583 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	MAG	P20916	626 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CXCR2	P25025	360 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CCR7	P32248	378 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	HSD17B2	P37059	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	POU3F4	P49335	361 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TTPA	P49638	278 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RGS4	P49798	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CBX1	P83916	185 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RELA	Q04206	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CD300C	Q08708	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CHIT1	Q13231	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	NRTN	Q99748	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	NBAS	A2RRP1	2371 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725		A0A1W2PQ72	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OR51F1	A6NGY5	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	LRRTM2	O43300	516 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OR1I1	O60431	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	C1orf105	O95561	183 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SERPINA7	P05543	415 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SDC1	P18827	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TBXA2R	P21731	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PAX7	P23759	505 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	CMPK1	P30085	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	PPT1	P50897	306 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	BDH1	Q02338	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	IL24	Q13007	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ART3	Q13508	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	SELPLG	Q14242	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	GRB7	Q14451	532 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OR2L3	Q8NG85	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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