RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF84P51523 738 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 CLRN1P58418 232 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 ERVK-25P63136 954 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 LRRC74AQ0VAA2 488 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 BST1Q10588 318 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF404Q494X3 552 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM201AQ5SY85 155 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 C10orf128Q5T292 105 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 SGCDQ92629 289 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 ITPKCQ96DU7 683 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 C4orf45Q96LM5 186 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 OR8B2Q96RD0 313 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 SEPHS2Q99611 448 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 CLN8Q9UBY8 286 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 TENM3Q9P273 2699 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM247A6NEH6 219 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF879B4DU55 563 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 TOX4O94842 621 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC2A10O95528 541 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 CH25HO95992 272 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 IGHG1P01857 330 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 ETS2P15036 469 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 PMELP40967 661 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 ERFP50548 548 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 ARHGDIAP52565 204 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 HERPUD1Q15011 391 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 RGNQ15493 299 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 SGCAQ16586 387 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF74Q16587 644 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 OGFOD2Q6N063 350 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 BBS10Q8TAM1 723 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 CMBLQ96DG6 245 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 NUF2Q9BZD4 464 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 TRIM15Q9C019 465 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 AIG1Q9NVV5 245 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 SELENONQ9NZV5 590 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGGTA-217ENST00000560521 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 IFNL4K9M1U5 179 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 PHYHO14832 338 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SURF4O15260 269 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ANP32DO95626 131 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 FSTL3O95633 263 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MPIG6BO95866 241 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 IGHV1-69P01742 117 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ASAH2BP0C7U1 165 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 BMP2P12643 396 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC6A2P23975 617 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ETV4P43268 484 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 RPL14P50914 215 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 COX10Q12887 443 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 TAF11Q15544 211 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM27BQ5VT28 67 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 Q6ZTK2 550 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 IFT20Q8IY31 132 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ASB10Q8WXI3 467 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 CFHR4Q92496 578 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 LHX4Q969G2 390 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 PHF21AQ96BD5 680 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 WDFY2Q96P53 400 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SORT1Q99523 831 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SIRPDQ9H106 197 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 PPCSQ9HAB8 311 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 NANSQ9NR45 359 aa7.39□□□□□ -1.23
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