RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 CDAP32320 146 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 RPL15P61313 204 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 ERVK-25P63136 954 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 PSG4Q00888 419 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 HIST3H3Q16695 136 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 C4orf45Q96LM5 186 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 MAGEB18Q96M61 343 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 IL19Q9UHD0 177 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.92□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 TMEM178BH3BS89 294 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 IFNL4K9M1U5 179 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 HDAC3O15379 428 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 TPST2O60704 377 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 ACADSP16219 412 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 PAX2Q02962 417 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 PSG7Q13046 419 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 C10orf128Q5T292 105 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC27A4Q6P1M0 643 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 KLBQ86Z14 1044 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 NSMAFQ92636 917 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 OR8B2Q96RD0 313 aa14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 GMNCA6NCL1 334 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 C3orf80F5H4A9 247 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 PIN1P1O15428 100 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 CLPXO76031 633 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC2A10O95528 541 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 ABHD16AO95870 558 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 F13BP05160 661 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 MELTFP08582 738 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 NR2C1P13056 603 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 AQP1P29972 269 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 KRTAP10-3P60369 221 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 CD47Q08722 323 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 SCARB2Q14108 478 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 LINC00114Q6XXX2 140 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 NPEPL1Q8NDH3 523 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 ASB10Q8WXI3 467 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 DYRK2Q92630 601 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 GTF2H4Q92759 462 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.9□□□□□ -0.02
TSPAN3-204ENST00000558394 M0R3H8 397 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 KITP10721 976 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 PPIBP23284 216 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 FGF12P61328 243 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 PCBD1P61457 104 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 BST1Q10588 318 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF774Q6NX45 483 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 PTOV1Q86YD1 416 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 LINC01006Q8NI28 216 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 OR2V2Q96R30 315 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 INIPQ9NRY2 104 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.89□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 UBDO15205 165 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 ICMTO60725 284 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF205O95201 554 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 CSF1P09603 554 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 TUBG1P23258 451 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 MMP16P51512 607 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 SMYD1Q8NB12 490 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 NABP1Q96AH0 204 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 MPP4Q96JB8 637 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 SEPHS2Q99611 448 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 TMEM165Q9HC07 324 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 GCM1Q9NP62 436 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.88□□□□□ -0.03
TSPAN3-204ENST00000558394 CLN8Q9UBY8 286 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms