RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGA2	P17301	1181 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	DNASE1	P24855	282 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	AQP2	P41181	271 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR4	P46093	362 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CRYBA2	P53672	197 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	UGT2B15	P54855	530 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PROK1	P58294	105 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TUBA1B	P68363	451 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TUBA4A	P68366	448 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	H3F3A	P84243	136 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SPIB	Q01892	262 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CHRNB3	Q05901	458 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FHL3	Q13643	280 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	KEAP1	Q14145	624 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MELK	Q14680	651 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	P2RY6	Q15077	328 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PDK3	Q15120	406 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PPA1	Q15181	289 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TAF11	Q15544	211 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SGCA	Q16586	387 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288		Q6ZT83	130 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	OAF	Q86UD1	273 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	OR5J2	Q8NH18	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF121	Q9H920	327 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	C12orf10	Q9HB07	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	DYSF	O75923	2080 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288		H7C1Q1	480 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	EBAG9	O00559	213 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ARPC2	O15144	300 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	OR10H3	O60404	316 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	NPIPB7	O75200	414 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	LYPD3	O95274	346 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	THY1	P04216	161 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	FABP3	P05413	133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	HSD17B1	P14061	328 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	EGR1	P18146	543 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MPG	P29372	298 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	RRM2	P31350	389 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ACVR1B	P36896	505 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	CSNK1A1	P48729	337 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	RASSF2	P50749	326 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SMIM11A	P58511	58 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PRPS1	P60891	318 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	ERVK-25	P63136	954 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	SORD	Q00796	357 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	MS4A2	Q01362	244 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PRKCD	Q05655	676 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PUDP	Q08623	228 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATXN3-238	ENST00000556288	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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