RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 KDM4DQ6B0I6 523 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 GPR137CQ8N3F9 429 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 SYT14Q8NB59 555 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 ICA1LQ8NDH6 482 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 NOXO1Q8NFA2 376 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 OR52L1Q8NGH7 329 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 OR6N1Q8NGY5 312 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 Q96M85 177 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 ZNF570Q96NI8 536 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 CRLF2Q9HC73 371 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 GPR35Q9HC97 309 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 TAS2R16Q9NYV7 291 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 KIF17Q9P2E2 1029 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 CMYA5Q8N3K9 4069 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 SAC3D1A6NKF1 404 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 BHLHE40O14503 412 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 IMPA2O14732 288 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 IDH3BO43837 385 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 OSMP13725 252 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 RPS6KA3P51812 740 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 CLRN1P58418 232 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 SLC36A3Q495N2 470 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 MESTQ5EB52 335 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 TMEM108Q6UXF1 575 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 TREML4Q6UXN2 200 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 PARP8Q8N3A8 854 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 RASD2Q96D21 266 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 BOD1Q96IK1 185 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 ALG12Q9BV10 488 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 IFT27Q9BW83 186 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 ULBP2Q9BZM5 246 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 SMURF2Q9HAU4 748 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 TBC1D23Q9NUY8 699 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 XKRYO14609 159 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 AHCYL1O43865 530 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 BAG2O95816 211 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 PTAFRP25105 342 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 CDH15P55291 814 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 TGFBR3Q03167 851 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 RCN1Q15293 331 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 GABRA6Q16445 453 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 CEACAM16Q2WEN9 425 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 ADCK1Q86TW2 530 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 LNX2Q8N448 690 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 WDR31Q8NA23 367 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 OR2T33Q8NG76 320 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 FAM216AQ8WUB2 273 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 MCHR2Q969V1 340 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 MUS81Q96NY9 551 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 CIB1Q99828 191 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 TSSK6Q9BXA6 273 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 NARFLQ9H6Q4 476 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 ZNF696Q9H7X3 374 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 ESM1Q9NQ30 184 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 MOKQ9UQ07 419 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-231ENST00000552222 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 CIB4A0PJX0 185 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SLC22A23A1A5C7 686 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 PRSS37A4D1T9 235 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 H3BN98 237 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 SOCS2O14508 198 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 AVPP01185 164 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 QDPRP09417 244 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 NR2C1P13056 603 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ANPEPP15144 967 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 MYBPC1Q00872 1141 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 CD47Q08722 323 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 THEM4Q5T1C6 240 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 C10orf128Q5T292 105 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 ZNF544Q6NX49 715 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-231ENST00000552222 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.8 ms