RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	MTOR	P42345	2549 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730		A0A096LPE4	126 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1W2PPZ6	126 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	PRKY	O43930	277 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CBR1	P16152	277 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	PTAFR	P25105	342 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	EPHA2	P29317	976 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	GSTT1	P30711	240 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CSNK2B	P67870	215 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	EFNB1	P98172	346 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CDSN	Q15517	529 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	TAB1	Q15750	504 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	OCLN	Q16625	522 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	TEX30	Q5JUR7	227 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	OR52N5	Q8NH56	324 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	PTP4A1	Q93096	173 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	LURAP1	Q96LR2	239 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	FAM183A	A6NL82	134 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730		E9PQ18	207 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	PHYH	O14832	338 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CRYGS	P22914	178 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CCKAR	P32238	428 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ATP6V1E1	P36543	226 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ENTPD1	P49961	510 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CDH11	P55287	796 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	RAB1A	P62820	205 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ADAM8	P78325	824 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	IL5RA	Q01344	420 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ECH1	Q13011	328 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ARL9	Q6T311	187 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SKA3	Q8IX90	412 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	INTS14	Q96SY0	518 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CRYAA	P02489	173 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	GAA	P10253	952 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	COX5B	P10606	129 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	HTR1F	P30939	366 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CDA	P32320	146 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	PYCR1	P32322	319 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	NUDT6	P53370	316 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	APOF	Q13790	326 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ETFDH	Q16134	617 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF691	Q5VV52	312 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	WDR31	Q8NA23	367 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	TFAP2C	Q92754	450 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	TSSK2	Q96PF2	358 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	TEAD3	Q99594	435 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	RAB26	Q9ULW5	256 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	EDAR	Q9UNE0	448 aa		13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	IGKV3-15	P01624	115 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	APOC1	P02654	83 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	SERPINA5	P05154	406 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	APLNR	P35414	380 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	SLC15A1	P46059	708 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	MED21	Q13503	144 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	GGTLC2	Q14390	218 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	LINC01560	Q8TB33	94 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	NRG4	Q8WWG1	115 aa		13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28

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