RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531867.1

PUM1-222, Transcript of pumilio RNA binding family member 1, human

TSL 4

Gene PUM1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM1-222	ENST00000531867		A0A0U1RRA0	63 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867		J3QR06	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ABCD4	O14678	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF208	O43345	1280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OTC	P00480	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TPSB2	P20231	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PCMT1	P22061	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	AGTR1	P30556	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	IL2RG	P31785	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	BMI1	P35226	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MAGEA1	P43355	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MAGEA6	P43360	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MMP15	P51511	669 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CTBP2	P56545	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SLAMF1	Q13291	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	FHL1	Q13642	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	IL18	Q14116	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OR2M3	Q8NG83	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	LRRC39	Q96DD0	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF583	Q96ND8	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MED29	Q9NX70	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PHF11	Q9UIL8	331 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867		A0A0A6YYD5	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	LRP5L	A4QPB2	252 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	HELT	A6NFD8	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SCO2	O43819	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CIDEA	O60543	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TSPAN2	O60636	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SERPINI2	O75830	405 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	IL32	P24001	234 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	DCTD	P32321	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SSR2	P43308	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PPIC	P45877	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OR3A1	P47881	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SLC1A6	P48664	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CHRNB3	Q05901	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	COL21A1	Q96P44	957 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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