RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530309.1

CASP4-208, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-208	ENST00000530309	ARL9	Q6T311	187 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	BIVM	Q86UB2	503 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	OR5B12	Q96R08	314 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CHP1	Q99653	195 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CTDNEP1	O95476	244 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	H6PD	O95479	791 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	IGKV2D-28	P01615	120 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	BCHE	P06276	602 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	ACSM4	P0C7M7	580 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	OR5H8	P0DN80	308 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CX3CR1	P49238	355 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	OR7A5	Q15622	319 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309		Q6ZR03	302 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	UBALD1	Q8TB05	177 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	ABHD3	Q8WU67	409 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	SEH1L	Q96EE3	360 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF681	Q96N22	645 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF222	Q9UK12	451 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	NDUFAB1	O14561	156 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CHST1	O43916	411 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	DCK	P27707	260 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	LINC00483	Q53H64	154 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	RAB20	Q9NX57	234 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	ARID1A	O14497	2285 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309		A0A075B6Q4	140 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	RP2	O75695	350 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	OR2F2	O95006	317 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	RND2	P52198	227 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	C21orf59	P57076	290 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	SELENBP1	Q13228	472 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CUL2	Q13617	745 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	PON2	Q15165	354 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	RGN	Q15493	299 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	PLET1	Q6UQ28	207 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	PDXP	Q96GD0	296 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CDH16	O75309	829 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	PSMC3	P17980	439 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	ESRRG	P62508	458 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF726P1	Q15940	193 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF695	Q8IW36	515 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	GALNT14	Q96FL9	552 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM165	Q9HC07	324 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	HMG20A	Q9NP66	347 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84

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