RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522995.1

CEP170-223, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 3

Gene CEP170, Length 608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-223	ENST00000522995	COX10	Q12887	443 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	BIVM	Q86UB2	503 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	NUP37	Q8NFH4	326 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995		Q96MF0	132 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	B9D1	Q9UPM9	204 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.47	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	OR6C68	A6NDL8	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995		H7C1Q1	480 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	NDUFS7	O75251	213 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	PTH	P01270	115 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	CRABP1	P29762	137 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	ARHGDIA	P52565	204 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	GALK2	Q01415	458 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	FN3K	Q9H479	309 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	CDH20	Q9HBT6	801 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		13.46	□□□□□ -0.25
CEP170-223	ENST00000522995	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995		H3BN98	237 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	LY6G6D	O95868	133 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	CCNO	P22674	350 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	POU1F1	P28069	291 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	APLNR	P35414	380 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	PCBD1	P61457	104 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF774	Q6NX45	483 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	LNX2	Q8N448	690 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	OR51B6	Q9H340	312 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	GPRIN2	O60269	458 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	FAM157B	P0CG42	384 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	ANXA8	P13928	327 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	FAS	P25445	335 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	STOM	P27105	288 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	ATP6AP1	Q15904	470 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	MEP1B	Q16820	701 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	SYT9	Q86SS6	491 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	OR2T33	Q8NG76	320 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	SNX18	Q96RF0	628 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	DDO	Q99489	341 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	C1orf198	Q9H425	327 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	CMAHP	Q9Y471	501 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	C5orf49	A4QMS7	147 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995		B9A039	149 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CEP170-223	ENST00000522995	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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