RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 GALPQ9UBC7 116 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 Q9UF83 564 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ATG4BQ9Y4P1 393 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 AKAP6Q13023 2319 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CSPG4Q6UVK1 2322 aa2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 NCKAP5O14513 1909 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MPDZO75970 2070 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SYCE3A1L190 88 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 DEFB108AA8MXU0 73 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GOLGA8KD6RF30 607 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GOLGA8TH3BQL2 631 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GFYI3L273 518 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PFDN6O15212 129 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PSTPIP1O43586 416 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TSC22D2O75157 780 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLU7O95391 586 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 IFNB1P01574 187 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 APOC2P02655 101 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 POU2F1P14859 743 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PTNP21246 168 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GPX3P22352 226 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 IMPA1P29218 277 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RPL22P35268 128 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GCKP35557 465 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 HSD17B2P37059 387 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CD79BP40259 229 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GRIA1P42261 906 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLC1A1P43005 524 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLCO1A2P46721 670 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 STARP49675 285 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TBPL1P62380 186 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CRADDP78560 199 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP19Q14CB8 494 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SPHARQ15513 63 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TTLL9Q3SXZ7 439 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CTSL3PQ5NE16 218 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 UTF1Q5T230 341 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ATAD3CQ5T2N8 411 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC38Q5VT99 294 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 AGTRAPQ6RW13 159 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TMUB2Q71RG4 321 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC6Q86X45 466 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 LAX1Q8IWV1 398 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CPNE9Q8IYJ1 553 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KATNAL2Q8IYT4 538 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 C11orf42Q8N5U0 333 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PRELID2Q8N945 189 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OR5L2Q8NGL0 311 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OR4F5Q8NH21 305 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLC22A8Q8TCC7 542 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KRT35Q92764 455 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TM4SF19Q96DZ7 209 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TSNARE1Q96NA8 513 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RAB40CQ96S21 281 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SSX3Q99909 188 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 C19orf43Q9BQ61 176 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 DESI2Q9BSY9 194 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 UGT2B28Q9BY64 529 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OSBPL8Q9BZF1 889 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 HSD3B7Q9H2F3 369 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GRPEL1Q9HAV7 217 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ADAP2Q9NPF8 381 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CHRAC1Q9NRG0 131 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TNFRSF19Q9NS68 423 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLC22A7Q9Y694 548 aa2.74□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF407Q9C0G0 2248 aa2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 FAM168BA1KXE4 195 aa2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KLLNB2CW77 178 aa2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CLOCKO15516 846 aa2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA0513O60268 411 aa2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GLCEO94923 617 aa2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OR6A2O95222 327 aa2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 VAPBO95292 243 aa2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TGDSO95455 350 aa2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MPC1LP0DKB6 136 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms