RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 ABHD13Q7L211 337 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRT77Q7Z794 578 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 ELP5Q8TE02 316 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMED6Q8WW62 240 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 ASB5Q8WWX0 329 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 PHYHIPQ92561 330 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 CMKLR1Q99788 373 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 MMP25Q9NPA2 562 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 MED12Q93074 2177 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR14I1A6ND48 311 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 H0YIZ8 118 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 H7C2Y5 167 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 BCL2L11O43521 198 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 CD8AP01732 235 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 SDHAP31040 664 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAB13P51153 203 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXL2P58012 376 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM225Q6GV28 225 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAB12Q6IQ22 244 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 MED25Q71SY5 747 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 NUBPLQ8TB37 319 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPACA5Q96QH8 159 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 CTSFQ9UBX1 484 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-211ENST00000512611 F8W036 122 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 H0YIG0 161 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 AGPAT2O15120 278 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 PMS2P2O95744 297 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 HLA-DOBP13765 273 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 VAMP1P23763 118 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAOBP27338 520 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SKP1P63208 163 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 CXADRP78310 365 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 BLOC1S1P78537 153 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAB11BQ15907 218 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDNFQ49AH0 187 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 AVL9Q8NBF6 648 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 BMFQ96LC9 184 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR2M4Q96R27 311 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 GAREM1Q9H706 876 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 LINC00587B1AMM8 73 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADAP1O75689 374 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPARCP09486 303 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBBP0CG47 229 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 GNB3P16520 340 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 IL11P20809 199 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 COL9A1P20849 921 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 GRK6P43250 576 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 PMPCAQ10713 525 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 MPPED2Q15777 294 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNF126Q9BV68 326 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-211ENST00000512611 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
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