RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 DPP10Q8N608 796 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR8B2Q96RD0 313 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 C1orf50Q9BV19 199 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ABCB9Q9NP78 766 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CUBNO60494 3623 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR6C6A6NF89 314 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC30A6NM36 301 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CLDN24A6NM45 220 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM233B4DJY2 109 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 IMPA2O14732 288 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SLC22A3O75751 556 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR7A10O76100 309 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 IL12AP29459 219 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TGFBR2P37173 567 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 IER3P46695 156 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LOXL3P58215 753 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GTF2H4Q92759 462 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 AJUBAQ96IF1 538 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CD300AQ9UGN4 299 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PRG6 482 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 FBP2O00757 339 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HDAC3O15379 428 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NPPAP01160 153 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LYNX1P0DP58 116 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PRG2P13727 222 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 RYKP34925 604 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 KIR2DS4P43632 304 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 WDR93Q6P2C0 686 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CADM2Q8N3J6 435 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC63Q8NA47 563 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.43□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 IFT81Q8WYA0 676 aa6.43□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CLPTM1O96005 669 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CRYBA1P05813 215 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 BCHEP06276 602 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 B4GALT1P15291 398 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CDKN2CP42773 168 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NPRL3Q12980 569 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZMYND11Q15326 602 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SNCBQ16143 134 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 COQ5Q5HYK3 327 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CARM1Q86X55 608 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR8G5Q8NG78 346 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NANOGQ9H9S0 305 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MED12Q93074 2177 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LHBP01229 141 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV1-69P01742 117 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CD247P20963 164 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PCGF2P35227 344 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SLC1A6P48664 564 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 DYNLT3P51808 116 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 BIDP55957 195 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 KRTAP10-3P60369 221 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.43□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NUDCD3Q8IVD9 361 aa6.43□□□□□ -1.38
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