RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 GSTM3P21266 225 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 MSR1P21757 451 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 LAP3P28838 519 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 NOS3P29474 1203 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPOXP50336 477 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM27BQ5VT28 67 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 LEG1Q6P5S2 330 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 ASRGL1Q7L266 308 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SVOPLQ8N434 492 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR8D4Q8NGM9 314 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 GIPC3Q8TF64 312 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 FOXN4Q96NZ1 517 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIMREGQ9BSJ6 248 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAB1BQ9H0U4 201 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLK3Q9H4B4 646 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 RERGLQ9H628 205 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 POLE4Q9NR33 117 aa16.58■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 CD5LO43866 347 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 CIB2O75838 187 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 CST2P09228 141 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF32P17041 273 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPS23P62266 143 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 HSF2Q03933 536 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 KRTAP1-1Q07627 177 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCNIQ14094 377 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC30A7Q8NEW0 376 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR4K13Q8NH42 304 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 C10orf105Q8TEF2 133 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 NMNAT3Q96T66 252 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 FEVQ99581 238 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 NUAK2Q9H093 628 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 EMC7Q9NPA0 242 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 YAE1D1Q9NRH1 226 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 IL20Q9NYY1 176 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNAJB9Q9UBS3 223 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 CMAHPQ9Y471 501 aa16.57■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 EBAG9O00559 213 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 BHLHE40O14503 412 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 IDH3BO43837 385 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TIPRLO75663 272 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCG5P05408 212 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF35P13682 527 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLP2Q04941 152 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNM1P34Q6PK57 102 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 GLB1L2Q8IW92 636 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 HS3ST5Q8IZT8 346 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SDR9C7Q8NEX9 313 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TSSK2Q96PF2 358 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SNX18Q96RF0 628 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF416Q9BWM5 594 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 C1orf198Q9H425 327 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARMC1Q9NVT9 282 aa16.56■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 DCTN6O00399 190 aa16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 RENP00797 406 aa16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 NR4A1P22736 598 aa16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 CRABP1P29762 137 aa16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 UGT2A3Q6UWM9 527 aa16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 CD300LDQ6UXZ3 194 aa16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 AKR7LQ8NHP1 331 aa16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR2H1Q9GZK4 316 aa16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 C12orf71A8MTZ7 269 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 NDUFS8O00217 210 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 GPRIN2O60269 458 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTHP01270 115 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCL2P13500 99 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 APEX1P27695 318 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 PCBD1P61457 104 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 GGTLC2Q14390 218 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TBC1D28Q2M2D7 210 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM249Q2WGJ8 235 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 OTPQ5XKR4 325 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR2T33Q8NG76 320 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 OR52E2Q8NGJ4 325 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.54■□□□□ 0.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 WNT5BQ9H1J7 359 aa16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms