RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 IGFL3Q6UXB1 125 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 OR6V1Q8N148 313 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 COX18Q8N8Q8 333 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 NHLRC2Q8NBF2 726 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 BEST4Q8NFU0 473 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 OR2L3Q8NG85 312 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 OR5D16Q8NGK9 328 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 OR14L1PQ8NHC6 308 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 STT3BQ8TCJ2 826 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 UPRTQ96BW1 309 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 LURAP1Q96LR2 239 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 RTN4RQ9BZR6 473 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CKLFQ9UBR5 152 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 GNG8Q9UK08 70 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 IKZF2Q9UKS7 526 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PLXNA3P51805 1871 aa3.57□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR171O14626 319 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PLA2G10O15496 165 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MT-ND4P03905 459 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 NAGAP17050 411 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 NPR2P20594 1047 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PUDPQ08623 228 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PMPCAQ10713 525 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MAPK14Q16539 360 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 GAB4Q2WGN9 574 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 C1QL3Q5VWW1 255 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 DTX1Q86Y01 620 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF595Q8IYB9 648 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 BMPERQ8N8U9 685 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 OR52E1Q8NGJ3 308 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SFXN5Q8TD22 340 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC41A3Q96GZ6 507 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PRAP1Q96NZ9 151 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ATF6BQ99941 703 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MIXL1Q9H2W2 232 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CBLCQ9ULV8 474 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 COL6A6A6NMZ7 2263 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00862A6NCI5 91 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 LEUTXA8MZ59 168 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 K7EQM0 130 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 HCRTR2O43614 444 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CHP2O43745 196 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 TBX19O60806 448 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ZG16O60844 167 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SC5DO75845 299 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ETHE1O95571 254 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 UCHL1P09936 223 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SELLP14151 372 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 UGT2B7P16662 529 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 NT5EP21589 574 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 FPR3P25089 353 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MC5RP33032 325 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 GDNFP39905 211 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 CTSCP53634 463 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 LIM2P55344 173 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 RAG2P55895 527 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ADAM8P78325 824 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 FGL1Q08830 312 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ACER2Q5QJU3 275 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF787Q6DD87 383 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 ACSM5Q6NUN0 579 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM107Q6UX40 140 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 Q6ZS92 163 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM122BQ7Z309 247 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 HMGN2P46Q86SG4 172 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.56□□□□□ -1.84
ANKRD28-213ENST00000498524 SIAH3Q8IW03 269 aa3.56□□□□□ -1.84
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