RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GPAT4Q86UL3 456 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RDH10Q8IZV5 341 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR6V1Q8N148 313 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 THEM6Q8WUY1 208 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 UCN2Q96RP3 112 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MCUBQ9NWR8 336 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OGG1O15527 345 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SC5DO75845 299 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 KDM4BO94953 1096 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GUSBP08236 651 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GALP22466 123 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SDHAP31040 664 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PITPNBP48739 271 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF81P51508 661 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 BAMBIQ13145 260 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 BIKQ13323 160 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MESTQ5EB52 335 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LIPNQ5VXI9 398 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GUSBP11Q6P575 273 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 FAM122BQ7Z309 247 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PXKQ7Z7A4 578 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 UPRTQ96BW1 309 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ABCG5Q9H222 651 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MBD2Q9UBB5 411 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LGALS8O00214 317 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ARL6IP5O75915 188 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 AKR7A3O95154 331 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HTR3BO95264 441 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OPN1LWP04000 364 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 EPXP11678 715 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 KLRB1Q12918 225 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GPR176Q14439 515 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TRAM1Q15629 374 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 BICRALQ6AI39 1079 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SYS1Q8N2H4 156 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RNF138Q8WVD3 245 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RFT1Q96AA3 541 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 C8orf44Q96CB5 159 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR6C1Q96RD1 312 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LAT2Q9GZY6 243 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 KNTC1P50748 2209 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PIN1P1O15428 100 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SUSD5O60279 629 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SERPINA3P01011 423 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ADH7P40394 386 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 FBXW4P57775 412 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DGCR2P98153 550 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ACY1Q03154 408 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TNK1Q13470 666 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GGTLC2Q14390 218 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ETFDHQ16134 617 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TPRA1Q86W33 373 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.29□□□□□ -1.4
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