RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 BTDP43251 543 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 BLVRAP53004 296 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 ATP5J2P56134 94 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 BCL2L1Q07817 233 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 ART3Q13508 389 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 CLINT1Q14677 625 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 KIAA0040Q15053 153 aa3.65□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.65□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 ACER1Q8TDN7 264 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 CACNG8Q8WXS5 425 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 FGGYQ96C11 551 aa3.65□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 C19orf24Q9BVV8 132 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 MED4Q9NPJ6 270 aa3.65□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 PRSS16Q9NQE7 514 aa3.65□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.64□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.64□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 CHID1Q9BWS9 393 aa3.64□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa3.64□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 RHOCP08134 193 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 IGLL1P15814 213 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 IVDP26440 423 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 PCK1P35558 622 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 KIR2DS4P43632 304 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 RAB7AP51149 207 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 RORCP51449 518 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 P2RY4P51582 365 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 CLDN6P56747 220 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 SKP1P63208 163 aa3.63□□□□□ -1.83
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