RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482871.5

MSL3-215, Transcript of MSL complex subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene MSL3, Length 834 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3-215ENST00000482871 MAP3K8P41279 467 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 ATP12AP54707 1039 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 GAS1P54826 345 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 TPTEP56180 551 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 OR2B6P58173 313 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 HSF2Q03933 536 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 FGFBP1Q14512 234 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 QPRTQ15274 297 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 TAB1Q15750 504 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 ZNF141Q15928 474 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 EXT1Q16394 746 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 AGAP6Q5VW22 663 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 HACD4Q5VWC8 232 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 ACSM6Q6P461 480 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 KLBQ86Z14 1044 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 CADM2Q8N3J6 435 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 EXTL1Q92935 676 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SGTBQ96EQ0 304 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 ART5Q96L15 291 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 AGAP4Q96P64 663 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 RERGLQ9H628 205 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 ABCB9Q9NP78 766 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SLC6A5Q9Y345 797 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 V9GYH0 126 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 PCSK5Q92824 1860 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.12□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 A0A1W2PQ72 361 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SERINC4A6NH21 518 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 A8MXE2 369 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 FAM25AB3EWG3 89 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 FAM25CB3EWG5 89 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 FAM25GB3EWG6 89 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 WWP2O00308 870 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 CDC42EP2O14613 210 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 IDH3BO43837 385 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 CDC14BO60729 498 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 CCNKO75909 580 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 ARL6IP5O75915 188 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 PPP1R3DO95685 299 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 CSTAP01040 98 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 IGF2P01344 180 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SERPINA7P05543 415 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 MAKP20794 623 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 CASP3P42574 277 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SLC6A8P48029 635 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SLC26A5P58743 744 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 PRPS1P60891 318 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 FABP5Q01469 135 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 NHLH2Q02577 135 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 IL18Q14116 193 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 MAPK14Q16539 360 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 HBMQ6B0K9 141 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SHFQ7M4L6 423 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SYS1Q8N2H4 156 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 GALNT16Q8N428 558 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 SCAIQ8N9R8 606 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 PFN4Q8NHR9 129 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 M1APQ8TC57 530 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 DOK4Q8TEW6 326 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 TM9SF4Q92544 642 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 PHYHIPQ92561 330 aa7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
MSL3-215ENST00000482871 ITFG2Q969R8 447 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms