RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 CDH20Q9HBT6 801 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 B9D1Q9UPM9 204 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 LOC100509620A0A075B734 347 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 H7C1Q1 480 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 GNGT2O14610 69 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 MPZL1O95297 269 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 GSTM3P21266 225 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 STOMP27105 288 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 NOS3P29474 1203 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 TNK1Q13470 666 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 OTPQ5XKR4 325 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 ZNF774Q6NX45 483 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 CD300LDQ6UXZ3 194 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 OR6V1Q8N148 313 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SVOPLQ8N434 492 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 NPEPL1Q8NDH3 523 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 OR52L1Q8NGH7 329 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 COX4I2Q96KJ9 171 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 DDOQ99489 341 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 FEVQ99581 238 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 YY1AP1Q9H869 796 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 MTORP42345 2549 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 OR6C68A6NDL8 312 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 ARRDC5A6NEK1 342 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 C12orf71A8MTZ7 269 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SSX4O60224 188 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 GPANK1O95872 356 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 RENP00797 406 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 FAM157BP0CG42 384 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 EFNA4P52798 201 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 RPS23P62266 143 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 LSM6P62312 80 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 KCNMB1Q16558 191 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SDR9C7Q8NEX9 313 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 OR52E2Q8NGJ4 325 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 C11orf40Q8WZ69 217 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SORCS2Q96PQ0 1159 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 TSSK6Q9BXA6 273 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 DNAJB9Q9UBS3 223 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SOX14O95416 240 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 INHBBP09529 407 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 PCSK6P29122 969 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 EVX1P49640 407 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 PPOXP50336 477 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 NUDT6P53370 316 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 UCP2P55851 309 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 COX10Q12887 443 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 DNM1P34Q6PK57 102 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB46Q86UZ6 589 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 LRP11Q86VZ4 500 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 LNX2Q8N448 690 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 RACGAP1Q9H0H5 632 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D23Q9NUY8 699 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 ARMC1Q9NVT9 282 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 C5orf49A4QMS7 147 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 F12P00748 615 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 GAAP10253 952 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 CCNOP22674 350 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 WNT5AP41221 380 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 RAD52P43351 418 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 GDI2P50395 445 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 ERVS71-1P61550 626 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 ASRGL1Q7L266 308 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 HS3ST5Q8IZT8 346 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 OR4Q3Q8NH05 313 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 SYT3Q9BQG1 590 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 OR51B6Q9H340 312 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 FN3KQ9H479 309 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 NTN4Q9HB63 628 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 REV1Q9UBZ9 1251 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 FKBP7Q9Y680 259 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 E2F6O75461 281 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 TIPRLO75663 272 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 LY6HO94772 140 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 CENPAP49450 140 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 SCRN3Q0VDG4 424 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 AQP6Q13520 282 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 MEP1BQ16820 701 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 ZNF101Q8IZC7 436 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 SMR3AQ99954 134 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 BCL2L14Q9BZR8 327 aa18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
ACTB-211ENST00000480301 ASH2LQ9UBL3 628 aa18■□□□□ 0.47
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