RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480104.5

USP11-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 697 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-208ENST00000480104 SYNGR1O43759 233 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 CRCPO75575 148 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 FCN3O75636 299 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 PRG2P13727 222 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 PAX6P26367 422 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 MAGEA12P43365 314 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 DR1Q01658 176 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 LRFN4Q6PJG9 635 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 SATL1Q86VE3 508 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 ZNF440Q8IYI8 595 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 LRRC18Q8N456 261 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 MYDGFQ969H8 173 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 DPY30Q9C005 99 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.6□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 A0A087WUJ7 227 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 ADAM20O43506 726 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 AGR2O95994 175 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 IGF2P01344 180 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 KITLGP21583 273 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 VEGFCP49767 419 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 ERFP50548 548 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 BIDP55957 195 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 FAM69AQ5T7M9 428 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 ARL9Q6T311 187 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 OR2T11Q8NH01 316 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 ZNF607Q96SK3 696 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 SNX24Q9Y343 169 aa9.59□□□□□ -0.87
USP11-208ENST00000480104 HDAC3O15379 428 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 OR2T1O43869 369 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 ICMTO60725 284 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 IL7RP16871 459 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 IMPDH1P20839 514 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 GSTM3P21266 225 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 HTR5AP47898 357 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 ARHGDIAP52565 204 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 PUDPQ08623 228 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 GNA13Q14344 377 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 IL23RQ5VWK5 629 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 Q6ZS46 218 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 OR5AS1Q8N127 324 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 ATAD3AQ9NVI7 634 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 KLHL14Q9P2G3 628 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 MUC4Q99102 2169 aa9.58□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 CDHR4A6H8M9 788 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 ZNF32P17041 273 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 TAC1P20366 129 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 ECI1P42126 302 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 RGS6P49758 472 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 LUMP51884 338 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 PRKAA2P54646 552 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 ACSM1Q08AH1 577 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 FGFRL1Q8N441 504 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 Q8N7P7 452 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 ANKFN1Q8N957 763 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 PIFOQ8TCI5 191 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 TNFRSF14Q92956 283 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 SLC38A4Q969I6 547 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 CMBLQ96DG6 245 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 AJUBAQ96IF1 538 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 C4orf45Q96LM5 186 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 ELOVL3Q9HB03 270 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 TBCCD1Q9NVR7 557 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.57□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa9.56□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa9.56□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 F5H5P2 479 aa9.56□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 SLC28A1O00337 649 aa9.56□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 DVL1O14640 695 aa9.56□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 QDPRP09417 244 aa9.56□□□□□ -0.88
USP11-208ENST00000480104 IRF2P14316 349 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms