RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 CSNK1A1P48729 337 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 C9orf135Q5VTT2 229 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF544Q6NX49 715 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 CORO6Q6QEF8 472 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SPATC1Q76KD6 591 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 TIGD4Q8IY51 512 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 ZFP41Q8N8Y5 198 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 OR6N2Q8NGY6 317 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 AMELYQ99218 206 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 CENPOQ9BU64 300 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 GLTPQ9NZD2 209 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 CCRL2O00421 344 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 LALBAP00709 142 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SPNP16150 400 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 PTGS2P35354 604 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 IFITM2Q01629 132 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.158e-7■■■■□ 26
ATG4B-217ENST00000475693 HIST3H3Q16695 136 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SLC35F2Q8IXU6 374 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SNX18Q96RF0 628 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 NEK6Q9HC98 313 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 EMC7Q9NPA0 242 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 HAO2Q9NYQ3 351 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 DAPL1A0PJW8 107 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 FAM172BPA6NC97 362 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 WNT11O96014 354 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 IGHA1P01876 353 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 TDGF1P3P51864 188 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 ATCAYQ86WG3 371 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 ACBD7Q8N6N7 88 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 NANOGP1Q8N7R0 232 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 C9orf106Q8NAJ2 232 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SLC30A2Q9BRI3 323 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 KLHL9Q9P2J3 617 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 KCNG2Q9UJ96 466 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SLC35D3Q5M8T2 416 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 THEM4Q5T1C6 240 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 TSPO2Q5TGU0 170 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 P4HA3Q7Z4N8 544 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 CD163Q86VB7 1156 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM54Q969K7 222 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 MGLLQ99685 303 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 CRLF2Q9HC73 371 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 CLCF1Q9UBD9 225 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 MOKQ9UQ07 419 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 IGSF10Q6WRI0 2623 aa15.97■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 CCNKO75909 580 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 KRT8P05787 483 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 MYL12AP19105 171 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 CRABP1P29762 137 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 OR12D2P58182 307 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SIRPAP78324 504 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 ADAM8P78325 824 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 FOXF2Q12947 444 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 GGTLC2Q14390 218 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 TP53I3Q53FA7 332 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 FAM205BPQ63HN1 556 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 RTL6Q6ICC9 239 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SEM1Q6ZVN7 128 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 MCEMP1Q8IX19 187 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 C20orf196Q8IYI0 205 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 C11orf40Q8WZ69 217 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 ALG8Q9BVK2 526 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 TPK1Q9H3S4 243 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 EPG5Q9HCE0 2579 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 TTLL8A6PVC2 850 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 YES1P07947 543 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SPARCP09486 303 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 TRAPPC2P0DI81 140 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 TRAPPC2BP0DI82 140 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SLC26A10Q8NG04 563 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 OR6F1Q8NGZ6 308 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 INTS14Q96SY0 518 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 RNF122Q9H9V4 155 aa15.96■□□□□ 0.15
ATG4B-217ENST00000475693 SLC7A10Q9NS82 523 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms