RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474929.1

USP54-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 4

Gene USP54, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-211ENST00000474929 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 SH3GL3Q99963 347 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.51□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 LDLRAD4O15165 306 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ADAM20O43506 726 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 AKAP10O43572 662 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 CHST1O43916 411 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 GLRA3O75311 464 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 SEC22BO75396 215 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 SASH3O75995 380 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ZNF205O95201 554 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 LY6G6CO95867 125 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 SDC1P18827 310 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 SSTR1P30872 391 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 MYCNOSP40205 109 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ECI1P42126 302 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 THBS3P49746 956 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ERVFRD-1P60508 538 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 NAA20P61599 178 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 SLC7A5Q01650 507 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 GUCY1A3Q02108 690 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 BNIP2Q12982 314 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 PSG7Q13046 419 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 PTGR1Q14914 329 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 SMU1Q2TAY7 513 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 Q8TCH9 128 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 AJUBAQ96IF1 538 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 TSSK3Q96PN8 268 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ZNF607Q96SK3 696 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ERP44Q9BS26 406 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ZNF649Q9BS31 505 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ASPNQ9BXN1 380 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 C1orf109Q9NX04 203 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 GLTPQ9NZD2 209 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 CTSZQ9UBR2 303 aa6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 TMEM114B3SHH9 223 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 J3QW42 95 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 CFLARO15519 480 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 OR10H3O60404 316 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 IFNA6P05013 189 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 G6PDP11413 515 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 IL7RP16871 459 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ECHS1P30084 290 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 PLTPP55058 493 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 PLAURQ03405 335 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 PUDPQ08623 228 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 CALCOCO2Q13137 446 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 BLMHQ13867 455 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 MROH9Q5TGP6 573 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ATG16L1Q676U5 607 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 Q6ZR03 302 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 PXKQ7Z7A4 578 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 OR6S1Q8NH40 331 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ZNF566Q969W8 418 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ROPN1LQ96C74 230 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 FCRL1Q96LA6 429 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 OR5M11Q96RB7 305 aa6.49□□□□□ -1.37
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USP54-211ENST00000474929 EMC6Q9BV81 110 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 C12orf10Q9HB07 376 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 TCF19Q9Y242 345 aa6.49□□□□□ -1.37
USP54-211ENST00000474929 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.49□□□□□ -1.37
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