RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474409.1

CNN3-205, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CNN3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-205ENST00000474409 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.32□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.32□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.32□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.32□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 KALRNO60229 2985 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 DAPL1A0PJW8 107 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 C12orf71A8MTZ7 269 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 A8MXE2 369 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 MYL12BO14950 172 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 DOK2O60496 412 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 UBL3O95164 117 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SCG5P05408 212 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 CDK1P06493 297 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 LYNP07948 512 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 CST2P09228 141 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 OR2T7P0C7T2 308 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 PSKH1P11801 424 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 DCKP27707 260 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 CD79BP40259 229 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SLC15A1P46059 708 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 PCBD1P61457 104 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SLC35A2P78381 396 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 TSC22D1Q15714 1073 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 KCNMB1Q16558 191 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SLC36A2Q495M3 483 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 FAM27BQ5VT28 67 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 CORO6Q6QEF8 472 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 CDC20BQ86Y33 519 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 OR2T27Q8NH04 317 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 MNTQ99583 582 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SH3GL3Q99963 347 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 C1orf198Q9H425 327 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 RNF121Q9H920 327 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 JKAMPQ9P055 326 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 COPS3Q9UNS2 423 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 NKX2-6A6NCS4 301 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ZG16O60844 167 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 IGHA1P01876 353 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 MT-ND2P03891 347 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 CD79AP11912 226 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ZNF32P17041 273 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 CDH15P55291 814 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ACTA2P62736 377 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ACTG2P63267 376 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 TUBA1BP68363 451 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 TUBA4AP68366 448 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 PIGFQ07326 219 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 RAB35Q15286 201 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 GABRA6Q16445 453 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 TEX30Q5JUR7 227 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ZNF773Q6PK81 442 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 TUBA1AQ71U36 451 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SPATC1Q76KD6 591 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ZNF627Q7L945 461 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SKA3Q8IX90 412 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 SVOPQ8N4V2 548 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 GJC3Q8NFK1 279 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 OR52N5Q8NH56 324 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 OTOSQ8NHW6 89 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 THEM6Q8WUY1 208 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-205ENST00000474409 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms