RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474147.5

RBMS1-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-208	ENST00000474147	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	LYG1	Q8N1E2	194 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	MITD1	Q8WV92	249 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	RSC1A1	Q92681	617 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	OTUB2	Q96DC9	234 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	SMIM19	Q96E16	107 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	IGSF21	Q96ID5	467 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	BOD1	Q96IK1	185 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	TCFL5	Q9UL49	500 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	3.99	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	MASP2	O00187	686 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	KCNQ2	O43526	872 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	KDELR3	O43731	214 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	IL2RA	P01589	272 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	CST2	P09228	141 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	FURIN	P09958	794 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	OR5AC1	P0C628	307 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	OR13C7	P0DN81	318 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	IL9	P15248	144 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	BMI1	P35226	326 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	SOAT1	P35610	550 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	WNT5A	P41221	380 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	PPP1R1A	Q13522	171 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	PDE7A	Q13946	482 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	CDK5R1	Q15078	307 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	RNF151	Q2KHN1	245 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	MIDN	Q504T8	468 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	LBX2	Q6XYB7	198 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	SSX7	Q7RTT5	188 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	LYG2	Q86SG7	212 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	OR2L3	Q8NG85	312 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	OR4C6	Q8NH72	309 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	RAB8B	Q92930	207 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	TAAR8	Q969N4	342 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	PCED1B	Q96HM7	432 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	PRRC1	Q96M27	445 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	CSTL1	Q9H114	145 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	ASB8	Q9H765	288 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	ARL15	Q9NXU5	204 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	UPB1	Q9UBR1	384 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147		V9GY05	133 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	TTC3	P53804	2025 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147		A0A087WWC5	75 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147		J3QW42	95 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	NDUFS8	O00217	210 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	KLF4	O43474	513 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	SMPD2	O60906	423 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	B4GALT2	O60909	372 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	PAPLN	O95428	1278 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	TSPAN15	O95858	294 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC16A8	O95907	504 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	GBA	P04062	536 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBMS1-208	ENST00000474147	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms