RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 FPR2P25090 351 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 YAP1P46937 504 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 BAMBIQ13145 260 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 TAF11Q15544 211 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 VMACQ2NL98 169 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 MMEL1Q495T6 779 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 TTMPQ5BVD1 217 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 ARMCX4Q5H9R4 360 aa9.44□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 DPP10Q8N608 796 aa9.44□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.44□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 C4orf45Q96LM5 186 aa9.44□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 ALG10Q5BKT4 473 aa9.43□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 EVA1AQ9H8M9 152 aa9.43□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 NUP50Q9UKX7 468 aa9.43□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 SNX13Q9Y5W8 968 aa9.43□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 J3KTA2 159 aa9.42□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 CTXN1P60606 82 aa9.42□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 CDK5R2Q13319 367 aa9.42□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 FHL1Q13642 323 aa9.42□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 SLC9A3R2Q15599 337 aa9.42□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.42□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 MTX3Q5HYI7 312 aa9.42□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.42□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.42□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 DYDC1Q8WWB3 177 aa9.42□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 CMBLQ96DG6 245 aa9.42□□□□□ -0.9
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ACTB-209ENST00000473257 MED31Q9Y3C7 131 aa9.42□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa9.42□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 INSIG2Q9Y5U4 225 aa9.42□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 H0YL77 283 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 CD55P08174 381 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 ADH4P08319 380 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 DBHP09172 617 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 SELEP16581 610 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 GATA3P23771 443 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 RBM34P42696 430 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 HTR5AP47898 357 aa9.41□□□□□ -0.9
ACTB-209ENST00000473257 BTG1P62324 171 aa9.41□□□□□ -0.9
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