RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469534.1

ITGA6-208, Transcript of integrin subunit alpha 6, human

TSL 2

Gene ITGA6, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGA6-208	ENST00000469534	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534		A0A087WXM4	84 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534		J3QLW9	94 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	PRRG2	O14669	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	MYL12B	O14950	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	DHH	O43323	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	FZD7	O75084	574 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF432	O94892	652 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	TOX	O94900	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	VAMP5	O95183	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	CLPTM1	O96005	669 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	YES1	P07947	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	SBK2	P0C263	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	GAA	P10253	952 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF823	P16415	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF19	P17023	458 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	LAP3	P28838	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	CAPZA2	P47755	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	SLC25A1	P53007	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	OR12D2	P58182	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	CXCR4	P61073	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	TEK	Q02763	1124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	PMPCA	Q10713	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	MED22	Q15528	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	INA	Q16352	499 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	RFK	Q969G6	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	FAM221A	A4D161	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534		E9PI62	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	ACACB	O00763	2458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ITGA6-208	ENST00000469534	GPR171	O14626	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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