RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 SDR9C7Q8NEX9 313 aa5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 GHSRQ92847 366 aa5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 MFFQ9GZY8 342 aa5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 OR52D1Q9H346 318 aa5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 KLHL9Q9P2J3 617 aa5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 ASB4Q9Y574 426 aa5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 ROS1P08922 2347 aa5.4□□□□□ -1.54
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC88CQ9P219 2028 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 E9PLN8 166 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 CYR61O00622 381 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 TOR1AO14656 332 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 M6PRP20645 277 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 MSX1P28360 303 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 GNALP38405 381 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 EIF1P41567 113 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 AKR1C2P52895 323 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 HCCSP53701 268 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 CARD18P57730 90 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 TAS2R43P59537 309 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 AKR1C1Q04828 323 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 SWI5Q1ZZU3 235 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 PCGF3Q3KNV8 242 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 Q5BKY6 102 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 HBMQ6B0K9 141 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 JAGN1Q8N5M9 183 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM185AQ8NFB2 350 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 WDR34Q96EX3 536 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM38AQ9H6F2 299 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 ATPIF1Q9UII2 106 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 CSAG2Q9Y5P2 127 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 ALPK2Q86TB3 2170 aa5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 A0A087WUU8 490 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 SLC22A31A6NKX4 558 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 LEUTXA8MZ59 168 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 AHRRA9YTQ3 701 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 LINC01387J3KSC0 135 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 FARS2O95363 451 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 NTN1O95631 604 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 ABCD3P28288 659 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 GZMMP51124 257 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 PNLIPRP2P54317 469 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 DUSP8Q13202 625 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 EIPR1Q53HC9 387 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 METTL11BQ5VVY1 283 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF454Q8N9F8 522 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 ABHD4Q8TB40 342 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 FAM57AQ8TBR7 257 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 LGALS14Q8TCE9 139 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 ELP5Q8TE02 316 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM255BQ8WV15 326 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 SLC25A36Q96CQ1 311 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 OR5B2Q96R09 309 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 COMMD4Q9H0A8 199 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 SDHAF2Q9NX18 166 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 EMC3Q9P0I2 261 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 TRAV18A0A075B6X5 111 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 SULT2B1O00204 365 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 PRAMEF4O60810 478 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 PEX14O75381 377 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 UTS2O95399 124 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 AHSA1O95433 338 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 RLN2P04090 185 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 PIPP12273 146 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 FUT1P19526 365 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 FXYD6P3P58550 94 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 SORDQ00796 357 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 TLE4Q04727 773 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 FXNQ16595 210 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 AANATQ16613 207 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 OCLNQ16625 522 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 KLHL26Q53HC5 615 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 FAM71E1Q6IPT2 247 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 GPAT4Q86UL3 456 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM99Q8N816 258 aa5.39□□□□□ -1.55
SHQ1-205ENST00000468371 OR13C2Q8NGS9 318 aa5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms