RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	GSDMA	Q96QA5	445 aa		2.57	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	OR5B12	Q96R08	314 aa		2.57	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		2.57	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	EXO5	Q9H790	373 aa		2.57	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	PSG8	Q9UQ74	426 aa		2.57	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		2.57	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		2.57	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	GABARAP	O95166	117 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	RSPH10B	P0C881	870 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	MAG	P20916	626 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	GAL	P22466	123 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	DCK	P27707	260 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	MAS1L	P35410	378 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	NAMPT	P43490	491 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	CSNK1A1	P48729	337 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	ERCC8	Q13216	396 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	SELENBP1	Q13228	472 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	MAB21L1	Q13394	359 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	OR7A5	Q15622	319 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	PGGHG	Q32M88	737 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	SSX9	Q7RTT3	188 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	C8orf44	Q96CB5	159 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	FOPNL	Q96NB1	174 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM165	Q9HC07	324 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		2.56	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	WRB	O00258	174 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	AIRE	O43918	545 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	FKBP6	O75344	327 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	CLDN11	O75508	207 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	MED6	O75586	246 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	HLA-DPB1	P04440	258 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	OR5H8	P0DN80	308 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	UQCRFS1	P47985	274 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	ARG2	P78540	354 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	IL18	Q14116	193 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	ARL9	Q6T311	187 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	STARD4	Q96DR4	205 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	SEH1L	Q96EE3	360 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	OR2A5	Q96R48	311 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	PSG11	Q9UQ72	335 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		2.55	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	SMKR1	H3BMG3	65 aa		2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	CACNG3	O60359	315 aa		2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	ENTPD5	O75356	428 aa		2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	SERPINE2	P07093	398 aa		2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF823	P16415	610 aa		2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	BCKDHB	P21953	392 aa		2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	STOM	P27105	288 aa		2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	HMOX2	P30519	316 aa		2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	RAB9A	P51151	201 aa		2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	RND2	P52198	227 aa		2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF138	P52744	262 aa		2.54	□□□□□ -2
CLK1-208	ENST00000464454	PFN3	P60673	137 aa		2.54	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.8 ms