RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CCR4P51679 360 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF131P52739 623 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SLC18A1P54219 525 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 RHBDL3P58872 404 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MAXP61244 160 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MC2RQ01718 297 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 PIGFQ07326 219 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 RBBP4Q09028 425 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 OR5I1Q13606 314 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 GINS1Q14691 196 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC14Q15048 493 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 RAB30Q15771 203 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 KIZQ2M2Z5 673 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 GRIPAP1Q4V328 841 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC184Q52MB2 194 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 FAM209AQ5JX71 171 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CD300LDQ6UXZ3 194 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 GDPD4Q6W3E5 623 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ZYG11AQ6WRX3 759 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CFAP77Q6ZQR2 320 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SLC16A14Q7RTX9 510 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 DPY19L4Q7Z388 723 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 COA5Q86WW8 74 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 BAP18Q8IXM2 172 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 KBTBD2Q8IY47 623 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MKXQ8IYA7 352 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 UBQLNLQ8IYU4 475 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 GABRG1Q8N1C3 465 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CENPSQ8N2Z9 138 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MINDY1Q8N5J2 469 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 FAM216BQ8N7L0 139 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 Q8N9W7 124 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MFSD2AQ8NA29 543 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 RNF149Q8NC42 400 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 LINS1Q8NG48 757 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 OR5AU1Q8NGC0 362 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 OR11H4Q8NGC9 324 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 OR8J3Q8NGG0 315 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 OR2T34Q8NGX1 318 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 OR2T3Q8NH03 318 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 OR1F12Q8NHA8 337 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 AKR7LQ8NHP1 331 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 CLHC1Q8NHS4 586 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 STK32AQ8WU08 396 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ASB12Q8WXK4 309 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 AZIN2Q96A70 460 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ELMO3Q96BJ8 720 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 YIPF6Q96EC8 236 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SLC35A4Q96G79 324 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 PEX11GQ96HA9 241 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SLC46A1Q96NT5 459 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 FERMT1Q9BQL6 677 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00467Q9BRT7 94 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 YIPF4Q9BSR8 244 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ZMYND12Q9H0C1 365 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SIK2Q9H0K1 926 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 DCSTAMPQ9H295 470 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 PDCL3Q9H2J4 239 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SCPEP1Q9HB40 452 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 TRPV4Q9HBA0 871 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 PLEK2Q9NYT0 353 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF492Q9P255 531 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 IP6K2Q9UHH9 426 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ZFP30Q9Y2G7 519 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 WSB1Q9Y6I7 421 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 SCINQ9Y6U3 715 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ENPP4Q9Y6X5 453 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 KIF16BQ96L93 1317 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 A2MP01023 1474 aa-2.45□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 KDRP35968 1356 aa-2.46□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP-2.46□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 NISCHQ9Y2I1 1504 aa-2.46□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa-2.46□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF815PA8K554 130 aa-2.46□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF732B4DXR9 585 aa-2.46□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 HCG22E2RYF7 251 aa-2.46□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 I3L2K1 104 aa-2.46□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 TLR4O00206 839 aa-2.46□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 TOR1AO14656 332 aa-2.46□□□□□ -2.8
SNORD54-201ENST00000459159 NBR2O15453 112 aa-2.46□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms