RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GPX8	Q8TED1	209 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RELT	Q969Z4	430 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058		M0R233	179 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ISG15	P05161	165 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GTF2F2	P13984	249 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	DLX5	P56178	289 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	POU4F3	Q15319	338 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ST7L	Q8TDW4	575 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SNAPC5	O75971	98 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CXCL2	P19875	107 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ENPP1	P22413	925 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IGFBP4	P22692	258 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	HTR2C	P28335	458 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FBXW4	P57775	412 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OPCML	Q14982	345 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TOR2A	Q5JU69	321 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ARL5B	Q96KC2	179 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	KCNK17	Q96T54	332 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FOXQ1	Q9C009	403 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GLTP	Q9NZD2	209 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	HHLA2	Q9UM44	414 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	USP34	Q70CQ2	3546 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SULT1C2	O00338	296 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	C4BPB	P20851	252 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FMOD	Q06828	376 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TDH	Q8IZJ6	230 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	UBE2QL1	A1L167	161 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	C2orf72	A6NCS6	295 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	LDLRAD4	O15165	306 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SHOX	O15266	292 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	AQP8	O94778	261 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CD3D	P04234	171 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GABRA1	P14867	456 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF823	P16415	610 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	BCKDHB	P21953	392 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ACHE	P22303	614 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR7A5	Q15622	319 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SEH1L	Q96EE3	360 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MEGF11	A6BM72	1044 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CRYZL1	O95825	349 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RLN1	P04808	185 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MELTF	P08582	738 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ACTB	P60709	375 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ACTG1	P63261	375 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		15.15	■□□□□ 0.02

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