RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 NIPAL3Q6P499 406 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 BEND4Q6ZU67 534 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM99Q8N816 258 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 SLC37A3Q8NCC5 494 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 RASD2Q96D21 266 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 Q96M85 177 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 DDOQ99489 341 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 NGBQ9NPG2 151 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 INIPQ9NRY2 104 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa8.76□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 LRP5LA4QPB2 252 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 RIIAD1A6NNX1 92 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 E7EQL1 145 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 C11orf98E9PRG8 122 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 H7C417 338 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 IDH3BO43837 385 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 XPNPEP2O43895 674 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 ENTPD6O75354 484 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 HTR1AP08908 422 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 VSIG8P0DPA2 414 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 HLA-DOBP13765 273 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF3P17036 446 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 SLC2A5P22732 501 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 NOS3P29474 1203 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 IL2RGP31785 369 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 SLC15A1P46059 708 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 EFNA4P52798 201 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 RAC3P60763 192 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 SLC35A2P78381 396 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF91Q05481 1191 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 P2RY6Q15077 328 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 CARTPTQ16568 116 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 HBMQ6B0K9 141 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 PXKQ7Z7A4 578 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 ADCK1Q86TW2 530 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 NPEPL1Q8NDH3 523 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 SDR9C7Q8NEX9 313 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 OR10D3Q8NH80 312 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 ASB10Q8WXI3 467 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 SGCDQ92629 289 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 LRR1Q96L50 414 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 FOXN4Q96NZ1 517 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 SNX18Q96RF0 628 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 TEX12Q9BXU0 123 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 C12orf49Q9H741 205 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC182A6NF36 153 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 FAM183AA6NL82 134 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF716A6NP11 495 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 ABCD4O14678 606 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 PRODHO43272 600 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 RNF13O43567 381 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 CXCL13O43927 109 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-211ENST00000429899 FAM20BO75063 409 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms