RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPB13A6NJU9 1138 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPB4C9JG80 1138 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCGF2P35227 344 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVK-25P63136 954 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD47Q08722 323 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF154Q13106 437 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGCAQ16586 387 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPICQ8N5J4 248 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPP10Q8N608 796 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOSPD2Q8NHP6 518 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASSF5Q8WWW0 418 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGTBQ96EQ0 304 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPA33Q99795 319 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NANOGQ9H9S0 305 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSL2Q9HCI7 577 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL21Q9UJP4 597 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFAF1Q9Y375 327 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AUP1Q9Y679 476 aa11.12□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANGPT2O15123 496 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NGFP01138 241 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGF2P01344 180 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN19P0C672 248 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF12P17014 697 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM34P42696 430 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRYBA2P53672 197 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GUCA2AQ02747 115 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BAMBIQ13145 260 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF11Q15544 211 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTX3Q5HYI7 312 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM27BQ5VT28 67 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKAIN4Q8IVV8 208 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM255BQ8WV15 326 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2H1Q9GZK4 316 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM106BQ9NUM4 274 aa11.11□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MXK9 166 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAPPC2LH3BP13 241 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CST2P09228 141 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SBK2P0C263 348 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAP3P28838 519 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGDIAP52565 204 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R41P59536 307 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM155Q4W5P6 130 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TREML4Q6UXN2 200 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL36Q8N4N3 616 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF283Q8N7M2 679 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10A6Q8NH74 314 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM239Q8WW34 195 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIPHQ8WWY8 451 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C4orf45Q96LM5 186 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALG12Q9BV10 488 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRI1Q9BV20 369 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TXNIPQ9H3M7 391 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELOVL3Q9HB03 270 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EGFL7Q9UHF1 273 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INSIG2Q9Y5U4 225 aa11.1□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F5H0A9 414 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5F1O95221 314 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFRSF1AP19438 455 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A9P48067 706 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCBD1P61457 104 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTG1P62324 171 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNGT1P63211 74 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL13RA1P78552 427 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSG7Q13046 419 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK5R2Q13319 367 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFYCQ13952 458 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VMACQ2NL98 169 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALG10Q5BKT4 473 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF774Q6NX45 483 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC80Q76M96 950 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZER1Q7Z7L7 766 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A28Q96A46 364 aa11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIF3AQ9Y2N7 669 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms