RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 CTSVO60911 334 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 RAF1P04049 648 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 CHRM2P08172 466 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 GLI4P10075 376 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PLA2G7Q13093 441 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 ASAH1Q13510 395 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 CDK5R1Q15078 307 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF547Q8IVP9 402 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 OR10K1Q8NGX5 313 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 HAO2Q9NYQ3 351 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNG2Q9UJ96 466 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 DSCR3O14972 297 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 NXPH2O95156 264 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 IFNA4P05014 189 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM178AQ8NBL3 297 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 SMIM19Q96E16 107 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 DDOQ99489 341 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC22A11Q9NSA0 550 aa15.68■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM235A6NFC5 223 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 METTL12A8MUP2 240 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 MSTNO14793 375 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 MT-CO2P00403 227 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 RPA2P15927 270 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 BTN1A1Q13410 526 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PHLDA2Q53GA4 152 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 EMC4Q5J8M3 183 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 RHOUQ7L0Q8 258 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 MORN4Q8NDC4 146 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM43Q9BTV4 400 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 BIN3Q9NQY0 253 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 RREB1Q92766 1687 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 E9PI62 339 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 ZGLP1P0C6A0 271 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 EVX1P49640 407 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 NAXDQ8IW45 347 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 C22orf15Q8WYQ4 148 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC19A3Q9BZV2 496 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.67■□□□□ 0.12e-7■■■□□ 15.5
SH3BP4-202ENST00000392011 MSMO1Q15800 293 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 OR10K2Q6IF99 312 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 APH1AQ96BI3 265 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 SIGLEC11Q96RL6 698 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PRSS37A4D1T9 235 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 CCSO14618 274 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 VAMP5O95183 116 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 SFRP5Q5T4F7 317 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 SUMF2Q8NBJ7 301 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR119Q8TDV5 335 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 OR2A14Q96R47 310 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PFDN5Q99471 154 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 ABHD6Q9BV23 337 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR173Q9NS66 373 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PPV4 95 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM64BA6NI03 449 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 EFSO43281 561 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 LILRB5O75023 590 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PMS2P2O95744 297 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 CALCBP10092 127 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 CAMK2BQ13554 666 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PEA15Q15121 130 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 NT5CQ8TCD5 201 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 TPOP07202 933 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 S100A11P31949 105 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PPT1P50897 306 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR5BQ86VZ2 330 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 OR4C3Q8NH37 302 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 NME2P22392 152 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 ARL3P36405 182 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 ETV6P41212 452 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PNLIPRP2P54317 469 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 BTG1P62324 171 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 CTF1Q16619 201 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 CD276Q5ZPR3 534 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 FAAP20Q6NZ36 180 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 USP51Q70EK9 711 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 DOK3Q7L591 496 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PRSS41Q7RTY9 318 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 ISYNA1Q9NPH2 558 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 WBP1LQ9NX94 342 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHB10Q9UN67 800 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 IFITM5A6NNB3 132 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 FRZBQ92765 325 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF25Q9UIL4 384 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR160Q9UJ42 338 aa15.66■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 IFNA10P01566 189 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 GLULP15104 373 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4-202ENST00000392011 MDGA2Q7Z553 956 aa15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms