RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 A0A0U1RQS6 177 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGEF35A5YM69 484 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 BTBD17A6NE02 478 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 SMCO2A6NFE2 343 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 ARGFXA6NJG6 315 aa2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 SGK1O00141 431 aa2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 ABCD4O14678 606 aa2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 PLEKHA8P1O95397 391 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 DEXIO95424 95 aa2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 IGLV1-47P01700 117 aa2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 CASP14P31944 242 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 IFNA8P32881 189 aa2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP10-3P60369 221 aa2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 TIMM10P62072 90 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 BEX3Q00994 111 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 TGFBR3Q03167 851 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 PLD1Q13393 1074 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 OR5I1Q13606 314 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 ARFRP1Q13795 201 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 DOC2AQ14183 400 aa2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 OR56B2PQ8NGI1 322 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 NAT14Q8WUY8 206 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 NELFBQ8WX92 580 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 UCN3Q969E3 161 aa2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 CCDC127Q96BQ5 260 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 ITCHQ96J02 903 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 C12orf42Q96LP6 360 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 ZIM3Q96PE6 472 aa2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 C12orf4Q9NQ89 552 aa2.15□□□□□ -2.07
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PTPRC-205ENST00000391970 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 PPIL1Q9Y3C6 166 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 CBY1Q9Y3M2 126 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-205ENST00000391970 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa2.15□□□□□ -2.07
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