RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 CSO75390 466 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 MED6O75586 246 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 RP2O75695 350 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 AKR7A3O95154 331 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 AP2A1O95782 977 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 C6orf47O95873 294 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 AK1P00568 194 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 SERPINA3P01011 423 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV4-59P01825 116 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 MBP02144 154 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 MT-ND4LP03901 98 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 OPN1LWP04000 364 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 OPN1MWP04001 364 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 UBBP0CG47 229 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 PRPS2P11908 318 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 CD79AP11912 226 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 MYOGP15173 224 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 CNR1P21554 472 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 IDSP22304 550 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 AHCYP23526 432 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 MPZP25189 248 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 ABCD3P28288 659 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 PTPN6P29350 595 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 GNALP38405 381 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 SOX3P41225 446 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 CDKN1BP46527 198 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 ACLYP53396 1101 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 PNLIPRP2P54317 469 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 DIO3P55073 304 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 TAS2R39P59534 338 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 UFM1P61960 85 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 UBA52P62987 128 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 DYNLT1P63172 113 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 GLO1Q04760 184 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 ACSM1Q08AH1 577 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF345Q14585 488 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 SMCO1Q147U7 214 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP19Q14CB8 494 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 SPHARQ15513 63 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 MPPED2Q15777 294 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 SNAPC1Q16533 368 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 PYDC2Q56P42 97 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 FAM69AQ5T7M9 428 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM244Q5VVB8 128 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 TRIQKQ629K1 86 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 PRR5LQ6MZQ0 368 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 CFAP161Q6P656 301 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 GCNT7Q6ZNI0 430 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 DNM1P46Q6ZS02 220 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 CAMKMTQ7Z624 323 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 NAA40Q86UY6 237 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM69Q86WT6 500 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 CEP97Q8IW35 865 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 GPD1LQ8N335 351 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 OR2L5Q8NG80 312 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 OR56A4Q8NGH8 313 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 OR5M1Q8NGP8 315 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 OR9A4Q8NGU2 314 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 OR2T35Q8NGX2 323 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 OR56B4Q8NH76 319 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 TWIST2Q8WVJ9 160 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 DDOQ99489 341 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 LGMNQ99538 433 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-202ENST00000367364 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 ABCG8Q9H221 673 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 DPAGT1Q9H3H5 408 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-202ENST00000367364 IKZF5Q9H5V7 419 aa3.05□□□□□ -1.92
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