RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 CLDN22Q8N7P3 220 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 OSGIN2Q9Y236 505 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 E9PI62 339 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 TGM6O95932 706 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 LIPAP38571 399 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 SLC19A1P41440 591 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 OR51F2Q8NH61 342 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 PTTG3PQ9NZH4 202 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 TMPRSS11DO60235 418 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 SELEP16581 610 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 USP51Q70EK9 711 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 SVBPQ8N300 66 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 SLC30A7Q8NEW0 376 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 SLAMF6Q96DU3 332 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 TEAD3Q99594 435 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 EDEM2Q9BV94 578 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 ELK1P19419 428 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 TBXA2RP21731 343 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 PCSK6P29122 969 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 MYBPHQ13203 477 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 IHHQ14623 411 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 KLK4Q9Y5K2 254 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 GPX2P18283 190 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 ASH2LQ9UBL3 628 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 ACOT8O14734 319 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 IL2RAP01589 272 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 CBR1P16152 277 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 EMP3P54852 163 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 FCN2Q15485 313 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 PLPP6Q8IY26 295 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 NANPQ8TBE9 248 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 C4orf47A7E2U8 309 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 APOA2P02652 100 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 OR51S1Q8NGJ8 323 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 OR10X1Q8NGY0 326 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 OR52N1Q8NH53 320 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 CTSFQ9UBX1 484 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 OR6C76A6NM76 312 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 GCNT2Q8N0V5 402 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 OR51A4Q8NGJ6 313 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 OR51A2Q8NGJ7 313 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP22Q9NRW4 184 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD61A6NGH8 418 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 PRPH2P23942 346 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 ZFP92A6NM28 416 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 CD22P20273 847 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 EMDP50402 254 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 GFERP55789 205 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 UBAC2Q8NBM4 344 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 DPTQ07507 201 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 C3orf49Q96BT1 292 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 HBE1P02100 147 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 NID1P14543 1247 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 RBP2P50120 134 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35A2P78381 396 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 ACKR1Q16570 336 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 SLCO4A1Q96BD0 722 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 SPACA5Q96QH8 159 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 RNF167Q9H6Y7 350 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 BCO1Q9HAY6 547 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A11Q9NSA0 550 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 CHST2Q9Y4C5 530 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 ATP1B1P05026 303 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 GLI4P10075 376 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 ETV6P41212 452 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 RAB5CP51148 216 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 TLE1Q04724 770 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 MZB1Q8WU39 189 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 YIF1AO95070 293 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF626Q68DY1 528 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 OR13F1Q8NGS4 319 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 ASB1Q9Y576 335 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 BTBD17A6NE02 478 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 GFYI3L273 518 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 SRFP11831 508 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-201ENST00000332175 CTSLP07711 333 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms